Final Fantasy

Hra sa začína o tri roky po páde Cocoon, ako pulzné mesto, kde Serah žije a je napadnutá príšerami. Cudzinec menom Noel vyzerá, že zachráni mesto, a tvrdí, že je cestovateľom času od 700 AF. On prišiel do 3 AF cez Valhalla, na konci času, kde tvrdí, že stretol Lightning a stráži trón bohyne Etro, ktorá podľa mýtu ju vytvorilo ľudstvo. V rámci prevodu Lightning sa do Valhally paradoxu prepukli v čase, ktoré umožňujú cestovať v čase medzi určitých časových obdobiach cez Historiu Crux a menia históriu. Serah sa pripojí k Noelovi vyriešiť tieto paradoxy, a dúfajú, že nájdu svoju sestru. On dúfa, že sa zmení táto chmúrná budúcnosť.

Ich prvá cesta do Cocoon v 5 AF, kde sa schádzajú s Alyssou a zastavia obrie vojnové roboty z budúcnosti, prejdú na Yaschas Massive na Pulse v 10 AF. Tam nájdu Hopea, lídra Akadémie a Alyssu ako jeho asistenta. Záznam proroctva zo strany rady seeresses z Paddra, veril, že vymreli pred stáročiami. Jedno roztrieštené proroctvo ukazuje, že Lightning je v meste Valhalla. Mesto Paddra je zahalené zatmením, ktoré hovorí Noelovi, že sa to nemalo stať pred niekoľkými storočiami. Kým Serah a Noel vyriešia paradox, oni sa stretnú s Caiusom, ktorý vie, že Noel pochádza zo 700 AF a ktorý oponuje im v zmene časovej osiy a s Yeul, ktorá vyzerá rovnako ako dievča menom Yeul. Po vyriešení paradoxu, nová oblasť sa otvorí v Historii Crux, 1x AF Paddry a alternatívnej časovej línie, v ktorých nikdy nebolo zatmenie v 10 AF. Proroctvo teraz ukazuje Caiusa s Lightning vo Valhalle, rovnako ako pilier na podporu Cocoon zrúcaniny. Noel tvrdí, že sa odohráva okolo 400 AF, a ničí ľudskú populáciu, rovnako ako svet, čo vedie k vyhynutiu druhu od jeho vlastného času. Serah a Noel ďalej zisťujú, zatiaľ čo Hope a Alyssa pracujú na prevenciu pilierov zrútenia.

V 300 AF Cocoon, Snow, snúbenec Serah, ktorý zmizol z 3 AF pri hľadaní Lightning. Bojuje s obrovským paradoxom poháňaným príšerou, ktorá sa rozpúšťa na krištáľovom pilieri. Po vyriešení paradoxu, ktorý spomaľuje pád Cocoon až 500 AF, Snow zase zmizne ako anomália z iného času a k hrôze jeho Serah. Dvojica potom ide do mesta Academia na Pulse v 400 AF, kde sú napadnutí zo skupiny občanov a premenili sa na Cie'th od mesta Prota fal'Cie, ktorí tvrdili, že boli zabití vo veži v 200 AF po učení " zakázanej histórie ". Po Yeul v tej dobe zomreli, Noel a Serah idú do veže August 200 AF, kde zistia, že Hope, aby zabránil ničeniu kukly, urobil Prota fal'Cie Adama v 13 AF, ktorý pomáha udržiavať sa pri živote. Paradox, podľa poradia, spôsobil Prota fal'Cie AI stratu kontroly a zabil Hopea a Alyssu, a prevzal kontrolu nad akadémiou. Paradox je vyriešený, a dúfa, že v 1X AF vidí proroctvo dvojice bojujúceho Adama a rozhodne sa ho postaviť a vytvárať na alternatívne Academiu v 4xx AF. V tomto svete, pár nájde Hope a Alyssu, ktorá sa dala do stázy po stavebnej veži August. Oni vysvetlili im nový plán na výstavbu novej umelej kukly ako držať ľudstvo, ktoré Sára a Noel im pomohli, než znova odídu.

Avšak, Alyssa prezradí Noelovi a Sáre, že vedie ich do pasce Caiusa a kvôli tomu, že životný paradox  je odsúdený k zmiznnutiu v dôsledku nich, ktorým sa stanovuje časová os. Oddelila sa od Noela a Sára sa schádza niekoľkokrát s Yeul z celej histórie, ktorý vysvetľuje, že je seeress z Paddry a neustále sa prevteluje v celej histórii, zatiaľ čo Caius je jej nesmrteľný opatrovník. Vysvetľuje, že zakaždým, keď sa zmení časová os, čo  ju však šok zabije, Caius bol riadený šialeným sledovaním a vidí ako umiera znovu a znovu, a sa snaží zastaviť ju k rozpútaniu chaosu uväzneného vo Valhalle od Etra zničiť všetok ten čas. Sára, ktorá bola videná zakaždým, paradox je vyriešený, a tiež seeress a rizika smrti zakaždým, keď sa zmení na budúcnosť. Caius v bitke so Sárou ju zachytáva do nového sveta, rovnako ako to urobil s Noelom. Po rozbití bez jej pomoci sa Fang a Vanille, no a Sára oslobodí z Noela, v ktorom je posledný žijúci človek po jeho verzii s Yeulovou smrťou a opustí Caiusa pre Valhallu. Dvojica sa stretáva s Lightning v budúcej novej Bodhum v 700 AF, než konfrontuje Caiusa, najprv v Academii v 500 AF a potom vo Valhalle. Potom, čo ho porazila, sa transformuje do Jet Bahamuta a Serah a Noel sa zachránia pred Lightning. Po porážke, Caius tvrdí, že zabil Lightning vo svojej poslednej bitke a že jeho smrť zabije oslabené Etro. Noel odmietne zabiť svojho bývalého učiteľa, ale Caiové sily ho bodnú cez neho. Keď Sára a Noel sa vrátili do Academie v 500 AF, Cocoon klesol a nádej Nového Cocoona vzrástla. Sára zomrie v šoku pred Noelom, než vypukne čierny mrak z neba ako chaos, ktorý držal v pasci Etro a vybuchne a zničí celú dobu a robí svet na obraz Valhally. Lightning môže byť videná v chráme Etro, ako sedí na tróne ako vykryštalizovaná  bohyňa.